细胞裂解后，孵育结合了抗体的珠子，诱饵蛋白通过其抗体结合到Beads上，同时和诱饵蛋白互作的RNA，也一起沉淀到Beads上。洗涤掉未结合的RNA后，再用洗脱液将RNA-蛋白复合物从Beads洗脱下来，便得到RNA免疫沉淀产物。RIP产物既可用qPCR检测已知RNA，也可以二代测序检测未知RNA。
当没有合适的诱饵蛋白抗体时，可以通过表达融合了flag标签的诱饵蛋白，利用flag标签做免疫沉淀。即细胞过表达Flag-Bait，经裂解后与anti-Flag珠子孵育，诱饵融合蛋白与Beads结合，与诱饵融合蛋白互作的RNA“共沉淀”到Beads上，再经洗涤、洗脱后做qPCR或NGS测序。
RNA免疫沉淀RIP实验流程
带标签的RNA免疫共沉淀流程图：
RNA免疫沉淀RIP技术应用
筛选或验证与诱饵蛋白互作的RNA
RNA免疫沉淀RIP服务*辉骏优势
1. 近十年服务经验，客户成果发表在Nature Methods，Cell Research等高水平期刊上；
2. 可对围绕RNA结合蛋白开展的整体课题提供全方位方案建议；
3. 自有分子及细胞生物实验平台，能有效制定并执行最优的实验路线；
4. 售后技术支持将一直保持到客户发表文章，确保客户安心进行下游实验及投稿。
RNA免疫沉淀RIP服务信息
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项目名称 |
客户提供 |
结果交付 |
实验周期 |
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实验样本 |
1、诱饵蛋白WB检测图 |
3-4周 |
| RIP seq | 实验样本 诱饵蛋白的IP级抗体 实验信息表（样本信息，诱饵蛋白信息） |
1、诱饵蛋白WB检测图 |
6-7周 |
RNA免疫共沉淀RIP 客户文献
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1. Bao X.C. et al: Capturing the interactome of newly transcribed RNA.Nature Methods,15(3): 213–220. 2018，IF=28.467. |
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2. Bao. X.C. et al: The p53-induced lincRNA-p21 derails somatic cell reprogramming by sustaining H3K9me3 and CpG methylation at pluripotency gene promoters. Cell Research.2015, IF=13.9. 【研究内容】：客户利用RNA pull down、CoIP等技术，发现lincRNA-p21与HNRNPK结合，并和甲基化酶SETDB1、DNMT1形成复合物，作者通过RIP-qPCR进一步证实了细胞中存在该复合物。该复合物甲基化了多能性基因的启动子序列及相应组蛋白，并改变了它们的表达量，从而进一步影响体细胞重编程过程。 使用相关技术：RIPseq、RNA结合蛋白免疫共沉淀rip qpcr、质谱鉴定 |
